Mozart era molto più apprezzato a Praga che a Vienna e nella sua città Salisburgo perciò visitò molte volte la capitale boema.Nel suo primo viaggio in Gennaio del 1787 fu ospitato dal Conte Thun nel suo palazzo di Mala Strana, oggi Ambasciata Inglese, Thunovska 14 Praga 1.

Si racconta di un incontro tra Mozart e Casanova nel Palazzo Bretfeld, Nerudova 33 Praga 1 nello stesso mese.Sempre durante il suo primo viaggio abitò anche nella casa All’Angelo d’oro, Celetna 29 Stare Mesto Praga 1.

Per buona parte del suo secondo viaggio a Praga da Settembre a Novembre del 1787 Mozart abitò nella Villa Bertramka allora in campagna ora nel sobborgo di Smichov, Praga 5 Mozartova 2.Oggi non esiste più la villa originale, distrutta da un incendio ma si può visitare come museo dedicato al compositore con spartiti e il suo pianoforte. Oggi la villa è chiusa al pubblico.

Per comodità, durante la Prima del Don Giovanni avvenuta il 29 Ottobre 1787, abitò nella casa Ai Tre Leoni d’oro, Uhelny trh 1 vicino al Teatro Tyl.

Durante le sue visite praghesi Mozart suonò gli organi delle chiese di San Nicola a Mala Strana e nel Monastero di Strahov.

In occasione della sua morte ci fu una messe solenne nella chiesa di San Nicola a Mala Strana.